电子密度怎么分析报告/电子密度计算公式推导
PDB中配体的结构质量
在PDB档案中对配体结构质量进行排名,计算了PC1-fitting和PC1-geometry的复合指标,以便对PDB中的所有配体进行排名。特定配体结构的复合排名分数定义为与整体模型质量排名一致,表示PDB中具有较差拟合或几何质量的配体的百分比。复合排名分数具有最简单的解释:最差为0%,比较好为100%,中等质量为50%。
数据内容:当前版本基于2020年第1周发布的PDB内容,提供了23,496个生物分子复合物的结合亲和力数据,包括蛋白质配体、蛋白质蛋白质、蛋白质核酸和核酸配体复合物。所有结合数据均来自约40,500个原始借鉴文献。核心集:PDBbind核心集是一组相对较小的高质量蛋白质配体复合物,用于验证对接/评分方法。
如果目标蛋白没有晶体结构或未在PDB数据库中检索到,可以使用蛋白质结构预测方法来预测其结构。SwissModel等软件适用于预测没有结构的蛋白质,为分子对接提供必要的结构信息。
导入并优化结构:从PDB数据库导入蛋白文件。使用Schrodinger软件的处理工具优化蛋白结构。识别并选中配体:利用软件的快速选取功能识别蛋白中的共晶配体。选中配体并使用Fit工具栏放大并居中显示,以便详细查看。更改显示类型:在Style工具箱中,选取不同的显示类型以更改配体的表示形式。
和田玉检测报告上的参数
〖One〗、和田玉检测报告上的参数主要包括:矿物成分、密度、折射率、颜色、质地、结构特征以及可能的处理或优化情况。首先,矿物成分是判断和田玉真伪的关键指标。真正的和田玉主要由透闪石和阳起石组成,这两种矿物的含量会直接影响玉石的质量和价值。报告中会明确指出这两种矿物的比例,以及是否含有其他杂质矿物。
〖Two〗、经过上述检测,本样本的密度为02g/cm,硬度为2,折射率为61,光谱分析显示出和田玉特有的吸收带,化学成分分析结果与天然和田玉相符,微观结构观察显示典型的纤维交织状结构。综合以上参数,可以确认该样本为高质量的天然和田玉。
〖Three〗、和田玉检测报告上的参数主要包括以下几点:矿物成分:是判断和田玉真伪的关键,主要由透闪石和阳起石组成,报告中会明确这两种矿物的比例及是否含有其他杂质矿物。密度:是和田玉重要的物理性质之一,其密度通常在一定范围内,有助于鉴别真假。
用立式光学计测量轴径实验报告
首先将待测量的轴放入立式光学计中。根据实验要求选取合适的探头,接着打开仪器电源并进行初始化设置。调节光学计的参数,根据轴的尺寸进行合适的放大倍数和探头的选取。启动测量程序,根据程序的提示进行操作,将光学计移动到轴的两端进行测量。重复以上步骤,记录每次测量的数据。
立式光学计测量轴径产生误差的原因有以下:光路误差:立式光学计通过反射和折射原理进行测量,光路中的反射镜、透镜等元件会产生一定的误差,这种误差称为光路误差。光路误差会导致光线的偏折或反射不准确,从而影响轴径的测量精度。
以立式光学计为例,这种精密测量仪器的特点包括高精度、光学投影读数的清晰度和操作便捷性。它主要用于工厂计量室和检测机构,测量如钢球、滚柱等精密零件的外尺寸。这再次强调了测量范围和示值范围在实际应用中的重要性。总结来说,理解这两个概念对于正确选取和使用测量仪器,确保测量结果的准确性至关重要。
总的来说,立式光学计的测量方法结合了接触式测量的直接性和光学检测的精度优势,为各种精密测量任务提供了可靠的技术支持。其出色的测量精度和高可靠性,使其成为众多工业和科研领域不可或缺的测量工具。
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